华大生科讯 近期，我院张征锋老师在作物抗逆的生物信息学研究领域取得系列进展，研究成果分别发表于“自然”子刊Scientific Reports和植物学优秀期刊Plant Physiology。
干旱胁迫是影响植物生长的主要环境因子之一，近年来高通量测序技术与生物信息学的飞速发展为进一步深入研究胁迫应答机制提供了良好的契机。 在以水稻与旱稻为实验材料进行干旱胁迫下的比较转录组分析中，张征锋老师与华中农业大学团队合作挖掘到436个水稻与旱稻中差异表达的基因，并预测其主要功能与胁迫防御相关；在两个研究品系中检测到丰富的变异，包括70264个SNPs及2564个INDELs；1041个直系同源基因被检测在水稻与旱稻分化过程中受到强烈正选择，多数基因富集在光合作用系统中；与干旱胁迫下光合作用参数相关QTLs的整合分析揭示了受正选择的光合作用基因位于这些调控植物干旱胁迫响应的数量性状位点内；进一步的生理实验也证明了光合作用机器在水稻与旱稻之间的差异是旱稻应答干旱胁迫过程中的重要优势所在。另外，张征锋老师与比利时安特卫普大学团队合作，参与完成玉米干旱胁迫下苗期叶片基因表达的芯片数据分析及细胞动力学分析。该系列成果为今后作物适应干旱胁迫的进一步深入研究打下了良好基础。
据悉，张征锋老师近年来致力于计算生物学和遗传学的研究，主要研究方向涉及比较基因组学、转录调控研究相关的高通量数据分析（基因差异表达、选择性剪切、基因进化选择模式、遗传变异）、微生物宏基因组数据分析、基因家族与代谢路径进化分析、植物生长的细胞动力学分析等。
文章链接：http://www.nature.com/articles/srep19349
http://www.plantphysiol.org/content/169/2/1382.long
