1. 科技部转基因生物重大专项（2009ZX08009-117B）：棉纤维品质相关的重功能基因及特异调控原件，李学宝，350万。
2. 国家自然科学基金面上项目（30970972）：下丘间的调制对大蹄蝠听神经元声感受性和功能可塑性的影响研究，陈其才，35万。
3. 国家自然科学基金面上项目（30972012）：NISOD在维护聚球藻CC9311光合机构运转转中的功能研究，邱保胜，32万。
4. 国家自然科学基金面上项目（30970405）：Wolbachia感染对果蝇精子育性的影响，王玉凤，31万。
5. 国家自然科学基金面上项目（30972254）：血红素加氧酶-1基因在斑马鱼低氧适应中的功能研究，钟雪萍，31万。
6. 国家自然科学基金面上项目（30971635）：SOST基因-9247T/C多态性的功能和调节骨密度的机制研究，黄青阳，30万。
7. 国家自然科学基金面上项目（30970111）：蛋白组学研究SigmaB因子在单核细胞增生李斯特菌毒力表达调控中的作用，罗勤，30万。
8. 国家自然科学基金面上项目（30970136）：细胞色素C在杆状病毒诱导昆虫细胞调亡中的作用，彭建新，30万。
9. 国家自然科学基金面上项目（30972693）：瓜氨酸化修饰在COMP逃避免疫耐受驱动RA发病中的作用机制研究，耿辉，25万。
10.国家自然科学基金青年基金项目（30900073）：NAC转录因子在棉纤维细胞次生壁发育中的功能研究，黄耿青，20万。
11.国家自然科学基金青年基金项目（30900054）：稻瘟病菌CYP51与其拟制剂相互机理及其特异拟制剂研究，杨娇艳，20万。
12.国家自然科学基金主任基金项目（30970001）：黑胸散白蚁肠道内与纤维素降解过程相关共性菌的研究，杨红，8万。
13.新世纪人才计划项目（教技函(2009)7号）：2008年度新世纪优秀人才支持计划，邱保胜，50万。
14.国家重大科技专项：陡岸湖滨带低等生物群落恢复技术研究与示范，中国环境科学研究院主持，我校为子课题副组长单位。杨劭，65万。
15.国家九七三项目：棉花纤维品质性状相关功能基因的克隆与鉴定(2008)-2，继续项目，中科院微生物所牵头，华中师范大学为合作单位，李学宝，17.25万。
16.国家九七三项目：微囊藻在复合污染条件下的产毒机理及微囊藻毒素对浮游藻类的毒理效应，中国环境科学院牵头，华中师范大学为合作单位，高翔，10万。
17.国家九七三项目（2008CB418004）：水华蓝藻优势维持的动态机制-2009，南京大学牵头，华中师范大学为骨干单位，邱保胜，5万。
18.国家科技攻关项目（2008ZX07211-003）：东江干流水质敏感区污染系统控制技术集成与工程示范，环保部华南环境所项目主持，华中师范大学为子课题单位，杨劭，34.25万。
19.国家科技攻关项目（2008ZX08009-003）：重要性关基因克隆及功能验证，新品种培育科技重大专项，中科院遗传与发育生物学所牵头，华中师范大学为参与单位，李学宝，16万。
20.科技部国家基础平台建设专项（2005DKA21403）：教学标本标准化整理、整合及共享试点（2009），科技部国家基础平台建设专项，牵头单位四川大学本项目为2007年继续项目，王东，35万。
21.教育部重点项目（109118）：从精子发生基因差异表达的角度研究Wolbachia诱导果蝇CI的分子机制，王玉凤，10万。
